Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFBP49765 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFBP49765 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms