Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC11A1P49279 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC11A1P49279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms