Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMAN1P49257 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMAN1P49257 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms