Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFX5P48382 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RFX5P48382 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFX5P48382 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFX5P48382 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFX5P48382 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFX5P48382 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RFX5P48382 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX5P48382 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX5P48382 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX5P48382 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFX5P48382 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFX5P48382 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RFX5P48382 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RFX5P48382 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX5P48382 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX5P48382 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX5P48382 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX5P48382 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX5P48382 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX5P48382 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX5P48382 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX5P48382 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms