Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP5OP48047 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP5OP48047 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms