Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABRB2P47870 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GABRB2P47870 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABRB2P47870 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms