Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABIFP47224 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABIFP47224 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABIFP47224 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABIFP47224 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RABIFP47224 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABIFP47224 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABIFP47224 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABIFP47224 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RABIFP47224 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABIFP47224 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABIFP47224 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABIFP47224 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RABIFP47224 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RABIFP47224 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms