Protein–RNA interactions for Protein: P47082

AVT1, Vacuolar amino acid transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT1P47082 YKL151CYKL151C 1014 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 YML119WYML119W 1074 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 SUB1YMR039C 879 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 YNL050CYNL050C 813 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 YOR238WYOR238W 912 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 MET16YPR167C 786 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 PIF1YML061C 2580 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 YFL042CYFL042C 2025 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 MRS2YOR334W 1413 nt5.91□□□□□ -1.46
AVT1P47082 CEF1YMR213W 1773 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 DHH1YDL160C 1521 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 SRB5YGR104C 924 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 GAT4YIR013C 366 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 PSF2YJL072C 642 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 SMD2YLR275W 333 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 YBR051WYBR051W 351 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 ALG14YBR070C 714 nt5.9□□□□□ -1.46
AVT1P47082 YNL011CYNL011C 1335 nt5.9□□□□□ -1.47
AVT1P47082 RIO1YOR119C 1455 nt5.9□□□□□ -1.47
AVT1P47082 DPB2YPR175W 2070 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 AI4Q0065 1671 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 UTP7YER082C 1665 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 UPS3YDR185C 540 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 SLO1YER180C-A 258 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YGR182CYGR182C 354 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 ARD1YHR013C 717 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YHR127WYHR127W 732 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 PFS1YHR185C 714 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 BET4YJL031C 984 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 LDB18YLL049W 540 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YNR061CYNR061C 660 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YNR062CYNR062C 984 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YPL062WYPL062W 405 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 MRPS9YBR146W 837 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 TAH18YPR048W 1872 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 CLG1YGL215W 1359 nt5.89□□□□□ -1.47
AVT1P47082 SGE1YPR198W 1632 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 CBK1YNL161W 2271 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YHR045WYHR045W 1683 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 ALT1YLR089C 1779 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 IPK1YDR315C 846 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 URA3YEL021W 804 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 PRO3YER023W 861 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 TDH3YGR192C 999 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 PSR1YLL010C 1284 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YLL037WYLL037W 381 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YNL108CYNL108C 813 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YOL131WYOL131W 327 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YOR318CYOR318C 306 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 HSH49YOR319W 642 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 CBC2YPL178W 627 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 ITT1YML068W 1395 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 TEF1YPR080W 1377 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 TEF2YBR118W 1377 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 VMA2YBR127C 1554 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 MMP1YLL061W 1752 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 GAA1YLR088W 1845 nt5.88□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YCR001WYCR001W 315 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YGR042WYGR042W 816 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 CIR1YGR207C 786 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 PRM10YJL108C 1152 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 CBT1YKL208W 816 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 ERG3YLR056W 1098 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YNL013CYNL013C 378 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YNL146WYNL146W 303 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 UBC4YBR082C 447 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 TOS4YLR183C 1470 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YMR155WYMR155W 1644 nt5.87□□□□□ -1.47
AVT1P47082 EUG1YDR518W 1554 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YKR023WYKR023W 1593 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 FDC1YDR539W 1512 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 CPR4YCR069W 957 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 IDP1YDL066W 1287 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YGL230CYGL230C 444 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 SNX4YJL036W 1272 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 HEK2YBL032W 1146 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 RPB8YOR224C 441 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.86□□□□□ -1.47
AVT1P47082 BAP2YBR068C 1830 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 PHO8YDR481C 1701 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 RSC58YLR033W 1509 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 GPT2YKR067W 2232 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 WTM1YOR230W 1314 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 DAS2YDR020C 699 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 PPH3YDR075W 927 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 RSM28YDR494W 1086 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 VAB2YEL005C 849 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 YER084W-AYER084W-A 513 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 LYS5YGL154C 819 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 EFG1YGR271C-A 702 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 SYS1YJL004C 612 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 HMS2YJR147W 1077 nt5.85□□□□□ -1.47
AVT1P47082 SSK1YLR006C 2139 nt5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.2 ms