Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XCR1P46094 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XCR1P46094 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XCR1P46094 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XCR1P46094 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XCR1P46094 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XCR1P46094 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XCR1P46094 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
XCR1P46094 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
XCR1P46094 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XCR1P46094 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XCR1P46094 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XCR1P46094 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XCR1P46094 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XCR1P46094 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XCR1P46094 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XCR1P46094 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XCR1P46094 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XCR1P46094 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XCR1P46094 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XCR1P46094 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XCR1P46094 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XCR1P46094 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XCR1P46094 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XCR1P46094 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XCR1P46094 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
XCR1P46094 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms