Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSR1P43307 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR1P43307 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR1P43307 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR1P43307 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR1P43307 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR1P43307 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR1P43307 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR1P43307 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR1P43307 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR1P43307 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR1P43307 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR1P43307 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR1P43307 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR1P43307 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR1P43307 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR1P43307 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSR1P43307 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSR1P43307 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSR1P43307 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms