Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCAMP43121 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCAMP43121 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCAMP43121 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MCAMP43121 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MCAMP43121 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCAMP43121 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCAMP43121 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCAMP43121 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCAMP43121 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCAMP43121 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCAMP43121 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCAMP43121 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCAMP43121 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCAMP43121 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCAMP43121 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCAMP43121 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCAMP43121 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCAMP43121 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCAMP43121 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCAMP43121 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCAMP43121 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCAMP43121 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCAMP43121 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MCAMP43121 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms