Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM5CP41229 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5CP41229 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5CP41229 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms