Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV3P41162 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV3P41162 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV3P41162 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV3P41162 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV3P41162 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV3P41162 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV3P41162 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV3P41162 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV3P41162 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV3P41162 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV3P41162 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV3P41162 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV3P41162 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ETV3P41162 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV3P41162 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV3P41162 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV3P41162 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV3P41162 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV3P41162 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV3P41162 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV3P41162 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV3P41162 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms