Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SREBF1P36956 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SREBF1P36956 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SREBF1P36956 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms