Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACVR1BP36896 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACVR1BP36896 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms