Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHI3L1P36222 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHI3L1P36222 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHI3L1P36222 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHI3L1P36222 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms