Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX5P35711 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX5P35711 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX5P35711 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX5P35711 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX5P35711 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX5P35711 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX5P35711 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX5P35711 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX5P35711 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX5P35711 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX5P35711 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX5P35711 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX5P35711 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX5P35711 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX5P35711 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX5P35711 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX5P35711 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX5P35711 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX5P35711 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX5P35711 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX5P35711 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX5P35711 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms