Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms