Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2H1P32780 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2H1P32780 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2H1P32780 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms