Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A4P31645 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A4P31645 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A4P31645 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms