Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPP30301 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIPP30301 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIPP30301 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPP30301 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPP30301 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPP30301 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPP30301 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPP30301 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPP30301 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPP30301 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPP30301 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPP30301 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPP30301 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPP30301 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPP30301 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPP30301 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MIPP30301 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIPP30301 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIPP30301 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIPP30301 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIPP30301 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIPP30301 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MIPP30301 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MIPP30301 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms