Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD40LGP29965 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms