Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCSK1P29120 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCSK1P29120 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms