Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRMP28827 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRMP28827 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRMP28827 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRMP28827 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRMP28827 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRMP28827 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRMP28827 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRMP28827 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRMP28827 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRMP28827 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRMP28827 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRMP28827 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRMP28827 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRMP28827 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRMP28827 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRMP28827 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PTPRMP28827 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRMP28827 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRMP28827 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRMP28827 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
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