Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRB3P28472 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRB3P28472 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB3P28472 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms