Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMB9P28065 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms