Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK3P27448 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK3P27448 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK3P27448 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK3P27448 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARK3P27448 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARK3P27448 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARK3P27448 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARK3P27448 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MARK3P27448 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARK3P27448 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARK3P27448 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARK3P27448 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK3P27448 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK3P27448 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK3P27448 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK3P27448 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK3P27448 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARK3P27448 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARK3P27448 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARK3P27448 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARK3P27448 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARK3P27448 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MARK3P27448 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARK3P27448 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARK3P27448 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARK3P27448 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK3P27448 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARK3P27448 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARK3P27448 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARK3P27448 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARK3P27448 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARK3P27448 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARK3P27448 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARK3P27448 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARK3P27448 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms