Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTFP26441 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTFP26441 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTFP26441 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTFP26441 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTFP26441 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTFP26441 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTFP26441 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTFP26441 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTFP26441 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTFP26441 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTFP26441 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTFP26441 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTFP26441 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTFP26441 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTFP26441 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTFP26441 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTFP26441 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms