Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTX3P26022 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTX3P26022 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTX3P26022 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTX3P26022 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTX3P26022 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTX3P26022 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTX3P26022 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTX3P26022 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTX3P26022 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTX3P26022 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTX3P26022 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTX3P26022 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTX3P26022 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTX3P26022 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTX3P26022 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTX3P26022 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTX3P26022 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTX3P26022 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms