Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO1P25800 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO1P25800 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO1P25800 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO1P25800 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO1P25800 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO1P25800 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO1P25800 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO1P25800 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO1P25800 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO1P25800 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO1P25800 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO1P25800 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms