Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
YY1P25490 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
YY1P25490 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
YY1P25490 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
YY1P25490 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
YY1P25490 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
YY1P25490 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
YY1P25490 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
YY1P25490 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YY1P25490 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
YY1P25490 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
YY1P25490 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
YY1P25490 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YY1P25490 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YY1P25490 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
YY1P25490 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YY1P25490 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YY1P25490 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YY1P25490 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YY1P25490 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YY1P25490 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YY1P25490 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YY1P25490 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YY1P25490 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YY1P25490 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YY1P25490 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
YY1P25490 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YY1P25490 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YY1P25490 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
YY1P25490 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms