Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms