Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPH2P23942 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRPH2P23942 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRPH2P23942 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms