Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCP2P22307 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCP2P22307 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCP2P22307 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCP2P22307 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCP2P22307 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCP2P22307 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCP2P22307 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCP2P22307 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCP2P22307 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCP2P22307 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCP2P22307 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCP2P22307 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCP2P22307 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCP2P22307 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCP2P22307 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCP2P22307 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCP2P22307 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms