Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCP20941 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCP20941 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCP20941 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCP20941 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCP20941 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCP20941 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCP20941 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCP20941 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCP20941 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCP20941 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCP20941 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCP20941 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCP20941 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCP20941 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCP20941 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCP20941 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDCP20941 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCP20941 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCP20941 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCP20941 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCP20941 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCP20941 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCP20941 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCP20941 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCP20941 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCP20941 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCP20941 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCP20941 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCP20941 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCP20941 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCP20941 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms