Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NTF3P20783 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NTF3P20783 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NTF3P20783 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NTF3P20783 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NTF3P20783 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF3P20783 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF3P20783 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NTF3P20783 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTF3P20783 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms