Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXA5P20719 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA5P20719 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms