Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP4AP20648 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP4AP20648 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms