Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms