Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNNI3P19429 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI3P19429 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI3P19429 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TNNI3P19429 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNNI3P19429 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNNI3P19429 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms