Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT4P19013 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT4P19013 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT4P19013 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT4P19013 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT4P19013 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT4P19013 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT4P19013 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT4P19013 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT4P19013 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT4P19013 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT4P19013 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT4P19013 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT4P19013 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT4P19013 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT4P19013 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT4P19013 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT4P19013 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT4P19013 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT4P19013 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT4P19013 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT4P19013 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT4P19013 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT4P19013 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT4P19013 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT4P19013 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT4P19013 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT4P19013 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT4P19013 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms