Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A2P16615 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A2P16615 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms