Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPB42P16452 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EPB42P16452 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPB42P16452 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPB42P16452 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPB42P16452 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPB42P16452 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPB42P16452 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPB42P16452 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPB42P16452 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPB42P16452 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPB42P16452 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPB42P16452 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPB42P16452 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPB42P16452 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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