Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNT1P13805 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNT1P13805 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNT1P13805 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms