Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT5P13647 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT5P13647 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT5P13647 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT5P13647 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT5P13647 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT5P13647 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT5P13647 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT5P13647 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT5P13647 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT5P13647 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT5P13647 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT5P13647 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT5P13647 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT5P13647 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT5P13647 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT5P13647 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT5P13647 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT5P13647 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT5P13647 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT5P13647 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT5P13647 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms