Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
GP1BBP13224 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms