Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COX4I1P13073 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COX4I1P13073 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I1P13073 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms