Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP2P12643 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP2P12643 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP2P12643 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP2P12643 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP2P12643 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP2P12643 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP2P12643 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP2P12643 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP2P12643 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP2P12643 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP2P12643 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP2P12643 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP2P12643 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP2P12643 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP2P12643 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP2P12643 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP2P12643 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP2P12643 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP2P12643 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP2P12643 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP2P12643 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms