Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HARSP12081 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HARSP12081 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HARSP12081 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HARSP12081 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARSP12081 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARSP12081 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARSP12081 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARSP12081 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARSP12081 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARSP12081 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HARSP12081 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HARSP12081 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HARSP12081 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARSP12081 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARSP12081 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARSP12081 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARSP12081 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARSP12081 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HARSP12081 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARSP12081 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARSP12081 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARSP12081 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HARSP12081 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HARSP12081 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HARSP12081 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HARSP12081 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARSP12081 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARSP12081 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARSP12081 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARSP12081 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARSP12081 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HARSP12081 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HARSP12081 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HARSP12081 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms