Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFHP12036 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFHP12036 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFHP12036 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFHP12036 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFHP12036 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEFHP12036 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFHP12036 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFHP12036 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFHP12036 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFHP12036 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFHP12036 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFHP12036 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEFHP12036 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEFHP12036 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFHP12036 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFHP12036 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFHP12036 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFHP12036 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFHP12036 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFHP12036 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFHP12036 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFHP12036 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFHP12036 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFHP12036 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFHP12036 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms